Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRACR2AQ9BSW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRACR2AQ9BSW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRACR2AQ9BSW2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms