Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD6Q9BRQ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD6Q9BRQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms