Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF559Q9BR84 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms