Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.62
FYCO1Q9BQS8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
FYCO1Q9BQS8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
FYCO1Q9BQS8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FYCO1Q9BQS8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms