Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BPIFA3Q9BQP9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BPIFA3Q9BQP9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms