Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL2Q9BQD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL2Q9BQD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms