Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREX2Q9BQ50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREX2Q9BQ50 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TREX2Q9BQ50 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms