Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP1Q9BPW8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms