Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP2Q99959 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP2Q99959 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP2Q99959 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms