Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D3Q99576 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D3Q99576 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms