Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NAP1L3Q99457 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAP1L3Q99457 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms