Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCF12Q99081 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF12Q99081 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF12Q99081 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF12Q99081 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF12Q99081 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms