Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNKPQ96T60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNKPQ96T60 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms