Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UIMC1Q96RL1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UIMC1Q96RL1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UIMC1Q96RL1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms