Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF12Q96QT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms