Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG1Q96Q15 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG1Q96Q15 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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