Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAP1Q96NZ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms