Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC3BQ96NL0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC3BQ96NL0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC3BQ96NL0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms