Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM3Q96MX0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CMTM3Q96MX0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM3Q96MX0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms