Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
YTHDC1Q96MU7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
YTHDC1Q96MU7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
YTHDC1Q96MU7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms