Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ROBO3Q96MS0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ROBO3Q96MS0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms