Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZSWIM3Q96MP5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM3Q96MP5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM3Q96MP5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms