Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCHS1Q96JQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCHS1Q96JQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms