Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HHIPL1Q96JK4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HHIPL1Q96JK4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HHIPL1Q96JK4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPL1Q96JK4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPL1Q96JK4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPL1Q96JK4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPL1Q96JK4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPL1Q96JK4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HHIPL1Q96JK4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HHIPL1Q96JK4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms