Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS50Q96JG6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms