Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIG1Q96JA1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG1Q96JA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms