Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB1Q96FW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms