Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC10A4Q96EP9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC10A4Q96EP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC10A4Q96EP9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms