Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3CQ96E17 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3CQ96E17 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3CQ96E17 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms