Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM19Q96E16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM19Q96E16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM19Q96E16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms