Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB2Q96DC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms