Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTHRC1Q96CG8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTHRC1Q96CG8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTHRC1Q96CG8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms