Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG2BQ96BY7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG2BQ96BY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG2BQ96BY7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG2BQ96BY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms