Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC8Q96B26 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC8Q96B26 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms