Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM52Q96A61 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM52Q96A61 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRIM52Q96A61 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms