Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYAP1Q96A49 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYAP1Q96A49 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYAP1Q96A49 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYAP1Q96A49 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYAP1Q96A49 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYAP1Q96A49 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYAP1Q96A49 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYAP1Q96A49 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYAP1Q96A49 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms