Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1E2Q96A05 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1E2Q96A05 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms