Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX4Q969G2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX4Q969G2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms