Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD2Q969F2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKD2Q969F2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms