Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-CQ95604 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HLA-CQ95604 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms