Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMTQ93088 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms