Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDS1Q92903 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDS1Q92903 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms