Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROX1Q92786 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms