Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RORBQ92753 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RORBQ92753 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORBQ92753 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORBQ92753 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RORBQ92753 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORBQ92753 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RORBQ92753 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORBQ92753 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORBQ92753 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RORBQ92753 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORBQ92753 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORBQ92753 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORBQ92753 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RORBQ92753 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORBQ92753 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORBQ92753 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORBQ92753 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RORBQ92753 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORBQ92753 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORBQ92753 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORBQ92753 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORBQ92753 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORBQ92753 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORBQ92753 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RORBQ92753 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORBQ92753 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORBQ92753 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORBQ92753 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORBQ92753 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORBQ92753 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORBQ92753 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORBQ92753 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORBQ92753 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORBQ92753 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORBQ92753 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORBQ92753 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RORBQ92753 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORBQ92753 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORBQ92753 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORBQ92753 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RORBQ92753 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORBQ92753 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORBQ92753 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORBQ92753 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORBQ92753 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORBQ92753 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORBQ92753 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORBQ92753 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORBQ92753 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORBQ92753 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORBQ92753 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORBQ92753 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms