Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATAD2BQ8WXI9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms