Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCA10Q8WWZ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCA10Q8WWZ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
ABCA10Q8WWZ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCA10Q8WWZ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCA10Q8WWZ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms