Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKA2Q8WVK7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKA2Q8WVK7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms