Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX33Q8WV41 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX33Q8WV41 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX33Q8WV41 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms