Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIPC3Q8TF64 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC3Q8TF64 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC3Q8TF64 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC3Q8TF64 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms