Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPT2Q8TD30 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GPT2Q8TD30 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPT2Q8TD30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPT2Q8TD30 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
GPT2Q8TD30 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms